پيش از سال 1300 ق دوباره به عتبات عاليات بازگشت و در سامرا از دروس ميرزاى بزرگ شيرازى كامياب شد . با درگذشت ميرزا به نجف مراجعت فرمود و ملازم ميرزا حسين خليلى شد . وى به سال 1327 ق در كاظمين درگذشت . نمونه سروده در پشت كتاب « معارج الرضوان » مرحوم سيد ابو المكارم زنجانى به خط خودش و در مقام مدح كتاب نوشته است : يا راقياً مراقي العرفان * وعارجاً معارج الرضوان وطالباً مسالك التوحيد * في عالم الشهود والإيقان هذا كتاب ساطع البرهان * يهدي إلى الإسلام والإيمان فصوله يحكي ربيع الدين * ربيعه أشعّة العرفان جاء به من قلم الأشراق * كريم أهل البيت عدنان يا وارداً في مائه الزلال * منه حياة النفس بالإذعان اشرب هنيئاً في الحياة لم يزل * وعش مريئاً في درى الأكوان وى همچنين در مدح ميرزا ابو المكارم سروده است : رباني الدهر في الأسفار حتى * رأيت العيش منطمس السرور صرفت العمر في لهو ولعب * فياللّه من جهل غرور وكم أفنيت عمري في الذهول * فلم أدري غبوتاً من دبور وهذا الدهر قد أردي رجالًا * أسوداً من بني المجد الغيور فلا واللّه لا تأمن بليل * يريك ببدئه طيب السرور